# 一些概念
# 剪接
去除内含子将外显子连接起来成为成熟 mRNA 的过程称为剪接( splicing
)
# 剪接异构体
同一个前体 mRNA 通过不同的剪接方式产生不同的 mRNA 剪接异构体( transcript variant
)
# 转录本亚型
这种同一个基因翻译出来的亲兄弟,也被称为不同的转录本亚型( isoform
)
# 可变剪接的查询
- NCBI
- UCSC
- ensembl
# 基因选择
最好的数量是 2 个或者 3 个已知转录本
- 不同转录本编码同样的蛋白,但是 mRNA 的非翻译区不一样,所以翻译调控不一样
- 编码不同的蛋白但功能一样(悲剧结果)
- 编码不同的蛋白功能不一样,属于各司其职
- 蛋白具有不同功能不同机制 → 与转录本的不同关联
- 编码不同的蛋白功能不但不一样而且相反,具有拮抗作用
# 论证过程
- 类型
- 时间特异性
- 空间特异性
- 检测
- 设计引物 qPCR → 转录本检测
- Gain of function → 过表达载体,人为设计编码框
- Loss of function → 做不了
- Rescue → CRISPR 敲除一切转录本,加特异性载体
- 上下游检验
- 下游 → 解释表型
- 找明星分子或通路
- 上游 → 解释剪接
- 找可变剪接蛋白酶
- 下游 → 解释表型
- Crosstalk
- m6A + 可变剪接
- ncRNA + 可变剪接