# 一些概念

# 剪接

去除内含子将外显子连接起来成为成熟 mRNA 的过程称为剪接( splicing


# 剪接异构体

同一个前体 mRNA 通过不同的剪接方式产生不同的 mRNA 剪接异构体( transcript variant


# 转录本亚型

这种同一个基因翻译出来的亲兄弟,也被称为不同的转录本亚型( isoform


# 可变剪接的查询

  • NCBI
  • UCSC
  • ensembl

# 基因选择

最好的数量是 2 个或者 3 个已知转录本

  1. 不同转录本编码同样的蛋白,但是 mRNA 的非翻译区不一样,所以翻译调控不一样
  2. 编码不同的蛋白但功能一样悲剧结果
  3. 编码不同的蛋白功能不一样,属于各司其职
    • 蛋白具有不同功能不同机制 → 与转录本的不同关联
  4. 编码不同的蛋白功能不但不一样而且相反,具有拮抗作用

# 论证过程

  • 类型
    • 时间特异性
    • 空间特异性
  • 检测
    • 设计引物 qPCR → 转录本检测
    • Gain of function → 过表达载体,人为设计编码框
    • Loss of function → 做不了
    • Rescue → CRISPR 敲除一切转录本,加特异性载体
  • 上下游检验
    • 下游 → 解释表型
      • 找明星分子或通路
    • 上游 → 解释剪接
      • 找可变剪接蛋白酶
  • Crosstalk
    • m6A + 可变剪接
    • ncRNA + 可变剪接
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